MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 chromosome

Total Repeats: 20105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019776	TAA	2	6	3	8	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019776	AAACA	2	10	15	24	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019776	TAA	2	6	75	80	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019776	TAA	2	6	146	151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019776	TAA	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019776	ATT	2	6	241	246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019776	ATTGGG	2	12	256	267	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019776	TAA	2	6	292	297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019776	TAA	2	6	363	368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019776	ACT	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019776	ATA	2	6	404	409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019776	TAA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019776	TAA	2	6	453	458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019776	TAA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019776	A	6	6	542	547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019776	TAA	2	6	578	583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019776	CTG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019776	A	8	8	618	625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019776	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019776	AGA	2	6	681	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019776	TAA	2	6	722	727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019776	CAAT	2	8	748	755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019776	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019776	AT	3	6	832	837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019776	A	9	9	902	910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019776	A	6	6	931	936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019776	TA	4	8	977	984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019776	TCT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019776	TA	3	6	1067	1072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019776	TAA	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019776	TGA	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019776	CCT	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019776	GAG	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019776	AAAAGG	2	12	1896	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019776	TAA	2	6	1912	1917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019776	CT	3	6	1924	1929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019776	AT	3	6	1953	1958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019776	ACC	2	6	1968	1973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019776	GAT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019776	ATT	2	6	3256	3261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019776	AAT	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019776	ATT	3	9	3335	3343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019776	TAA	2	6	3344	3349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019776	AAT	2	6	3380	3385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019776	C	6	6	5938	5943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_019776	C	6	6	5949	5954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_019776	G	6	6	5961	5966	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019776	TCT	2	6	6047	6052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019776	CAT	2	6	6095	6100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019776	T	6	6	7539	7544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019776	CTTT	2	8	7565	7572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019776	T	7	7	7570	7576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019776	A	6	6	7631	7636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019776	GAA	2	6	7653	7658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019776	TTAAA	2	10	7659	7668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019776	TTA	2	6	8664	8669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019776	ATT	3	9	9328	9336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019776	T	6	6	9335	9340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019776	T	8	8	9398	9405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019776	A	6	6	9479	9484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019776	A	6	6	9490	9495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019776	AGAA	2	8	9522	9529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019776	A	6	6	9570	9575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019776	AAT	2	6	9602	9607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019776	TAA	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019776	ATGA	2	8	9664	9671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019776	AAAT	2	8	9689	9696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019776	A	6	6	9697	9702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019776	AAAT	2	8	9711	9718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019776	A	6	6	9729	9734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019776	AGT	2	6	9737	9742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019776	TTTA	2	8	9750	9757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019776	A	7	7	9757	9763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019776	T	7	7	9791	9797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019776	TAA	2	6	9823	9828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019776	AAT	2	6	9865	9870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019776	ATCT	2	8	10264	10271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019776	TTAA	2	8	10892	10899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019776	T	6	6	10940	10945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019776	TAT	2	6	10955	10960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019776	ATT	2	6	10965	10970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019776	TAAAT	2	10	14150	14159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019776	ATC	2	6	14183	14188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019776	TA	3	6	14201	14206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019776	TAAAA	2	10	14240	14249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019776	AAG	2	6	14869	14874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019776	AAT	2	6	15867	15872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019776	ATA	2	6	15925	15930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019776	A	7	7	15930	15936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019776	A	6	6	17502	17507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019776	TTTTTA	2	12	17552	17563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019776	TAA	2	6	17566	17571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019776	TTTTTA	2	12	17587	17598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019776	TAGT	2	8	17607	17614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019776	ATT	2	6	17641	17646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019776	T	6	6	17652	17657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019776	TAA	2	6	17668	17673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019776	TATT	2	8	17699	17706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019776	AGT	2	6	17746	17751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019776	TTG	2	6	17773	17778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019776	T	8	8	18623	18630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019776	A	6	6	18714	18719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019776	A	6	6	18747	18752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019776	AATTT	2	10	18757	18766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019776	CAA	2	6	18822	18827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019776	CAT	3	9	18840	18848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019776	TTA	2	6	18870	18875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019776	A	8	8	18886	18893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019776	TAT	2	6	18896	18901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019776	ATT	3	9	21787	21795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019776	T	6	6	21860	21865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019776	CCGATA	2	12	21890	21901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019776	TTG	2	6	21938	21943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019776	CAT	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019776	TTG	2	6	22736	22741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019776	A	6	6	22751	22756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019776	A	6	6	22771	22776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019776	A	6	6	22793	22798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019776	TA	3	6	22805	22810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019776	A	8	8	22846	22853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019776	AC	3	6	22866	22871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019776	TAT	2	6	23929	23934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019776	TAAGA	2	10	23977	23986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019776	T	6	6	24022	24027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019776	TGA	2	6	24112	24117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019776	TTA	2	6	24123	24128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019776	ATG	2	6	24159	24164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019776	ATCTT	2	10	24257	24266	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019776	TTC	2	6	24296	24301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019776	TTTA	2	8	24347	24354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019776	GTA	2	6	24364	24369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019776	ATT	3	9	24393	24401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019776	TAA	2	6	24402	24407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019776	TAAT	2	8	24461	24468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019776	ATTT	2	8	24498	24505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019776	T	6	6	24503	24508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019776	AACC	2	8	24563	24570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019776	GA	3	6	24637	24642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019776	AAT	2	6	24658	24663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019776	C	6	6	24712	24717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_019776	G	6	6	24724	24729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019776	G	6	6	24735	24740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019776	T	7	7	24775	24781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019776	CAT	2	6	24785	24790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019776	TAG	2	6	24890	24895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019776	GCT	2	6	24906	24911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019776	AGG	2	6	24983	24988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019776	T	6	6	26017	26022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019776	TTTTA	2	10	26053	26062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019776	TATT	2	8	26070	26077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019776	ATTA	2	8	26088	26095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019776	A	7	7	27018	27024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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